什么是序列(什么是序列比对?)

什么是序列比对?

双序列对比是指将两个序列进行比较，以确定它们之间的相似性或差异性。序列可以是DNA、RNA或蛋白质序列等，通过对这些序列的比较，可以对它们进行分类、寻找基因突变或识别重要功能区域等。在生物信息学领域，双序列对比是一项重要的技术，被广泛应用于基因组学、进化生物学、医学和药物研发等领域。双序列对比的方法包括全局对比、局部对比和多序列对比等，根据不同的需求选择不同的方法可以提高比较的准确性和效率。

什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵

进化论：通常指生物界的进化理论，亦称“演化论”，旧称“天演论”。

进化论一词最初为法国博物学家拉马克(1744年一1829年)提出；英国博物学家达尔文的《物种起源》一书奠定了进化论的科学基础。达尔文认为生物进化的主导力量是自然选择。现代生物科学的发展，对生命起源、物种分化和形成等进化的理论研究有了进一步发展，认为生物最初从非生物进化而来，现代生存的各种生物，有共同的祖先

在进化过程中，通过变异、遗传和自然选择，生物从低级到高级，从简单到复杂，种类由少到多。恩格斯给予达尔文进化论以很高的评价，认为这一理论是19世纪自然科学三大发展之一

什么是序列比对的E值

A和E分别是DNA的四个碱基，其中A代表腺嘌呤，E代表尿嘧啶DNA是由四种碱基A、T、G、C连接而成的一个分子，在细胞的生物学过程中起到了关键作用而腺嘌呤和尿嘧啶是其中的两种基本构成单元，分别以氢键的形式互相配对，构成DNA的基本结构除了A和E以外，另外两种碱基T和G分别代表胸腺嘧啶和鸟嘌呤，同样也是组成DNA分子的重要结构单元通过各种特殊的序列组合，DNA分子可以编写出所有生命体的遗传信息

什么是序列比对?为什么要进行序列比对?

如何用dnaman比对两个基因的序列

所谓重叠基因是指两个或两个以上的基因共有一段DNA序列，或是指一段DNA序列成为两个或两个以上基因的组成部分。

重叠基因有多种重叠方式。例如，大基因内包含小基因；前后两个基因首尾重叠一个或两个核苷酸；几个基因的重叠，几个基因有一段核苷酸序列重叠在一起，等等。重叠基因中不仅有编码序列也有调控序列，说明基因的重叠不仅是为了节约碱基，能经济和有效地利用DNA遗传信息量，更重要的可能是参与对基因的调控。

什么是序列比对

一、区别

1、概念不同

同源性（homology）：进化过程中源于同一祖先的分支之间的关系，同源性是来描述物种之间的进化关系的，所以在同源性的表达中只能用“有”或者“无”，对于有同源性的物种可以描述为“部分同源”或者“完全同源”。

相似性（similarity）：是指所检测的序列与目标序列之间相同的碱基或氨基酸占整个序列的比例（相对宏观的一个描述）。在氨基酸序列比对中相似性还包括，除了完全相同的残基外，在对应位置的两个残基是否具有相似的特性，如侧链基团的大小、电荷性、亲疏水性等。

比如在氨基酸序列的比对中（以vector NTI为例），完全相同的氨基酸都会被标为黄色，特性相似的氨基酸会被标为绿色。

2、表达方式不同

同源性的表达中只能用“有同源性”或者“无同源性”，对于有同源性的物种可以描述为“部分同源”或者“完全同源”。

相似性可以表达为“两条序列具有80%的相似性”，表示所检测的序列与目标序列之间相同的碱基或氨基酸占整个序列的比例为80%。

二、联系

相似性与同源性的氨基酸或核苷酸序列通常有显著的一致性（identity），如果两条序列有一个共同的进化祖先，那么它们是同源的。这里不存在同源性（homology）的程度问题，两条序列要么是同源的要么是不同源的。

同源性（homology）这个概念不能量化，“两条序列具有同源性”或者“不具有同源性”。而相似性（similarity）和一致性（identity）可以看作是从不同的角度对同源性的量化指标。

一般地，两条序列之间的相似性（similarity）的程度会大于一致性（identity）的程度。一般来说，序列之间的相似性（similarity）和一致性（identity）越高，序列之间同源的可能性越大。

扩展资料：

同源性的特性：

同源性是比较生物学中的一个中心概念。同源，最基本的意义就是具有共同祖先。一般来说，如果两个物种中有两个性状（状态）满足以下两个条件中的任意一个，就可以称这两个性状为一对同源性状：

1、它们与这些物种的祖先类群中所发现的某个性状相同；

2、它们是具有祖先—后裔关系的不同性状。

由于进化上或个体发育上的共同来源而呈现的本质上的相似性，但其功能不一定相同，如狗的前肢和鸟的翅。从分子水平讲则是指两个核酸分子的核苷酸序列或两个蛋白质分子的氨基酸序列间的相似程度。

虽然同源性须通过序列测定来检验，但是DNA-DNA或DNA-RNA杂交可提供有价值的估计。

什么是序列比对的概念

体素内不相干运动(IVIM)MR成像是扩散加权成像方法的一种，该技术使用多个b值和双指数信号模型，能够产生反映组织微血管灌注和组织扩散率的定量参数。在低b值(例如，200秒/mm2)时，伪灌注分数f和伪扩散系数D*可以评价灌注特性。

在高b值(如200到1000秒/mm2)时，扩散系数D可以反映与组织细胞密度有关的水的扩散。虽然IVIM参数的病理生理学意义有待进一步研究(15)，但多项研究表明，f和D值是评估实体和血液肿瘤中血管生成的血管体积分数和细胞数量的影像学标志物。

什么是序列比对法

功能标记法（functional annotation）是一种用于描述基因或蛋白质功能的方法。它通过对基因序列或蛋白质序列进行比对分析，将其与已知功能的序列进行比较，以确定其可能的功能。功能标记法可以包括基于序列的比对、结构域分析、线索搜寻等多种方法，以获得对目标序列功能的预测。级数标记法（series expansion）是一种数学方法，用于将函数进行无穷级数展开。它将复杂的函数表示为一系列简单函数的和，从而方便进行计算和分析。级数标记法通常使用泰勒级数、幂级数或傅立叶级数等进行展开，通过逐渐增加级数项来逼近原函数的形式。两者不同，功能标记法主要用于预测基因或蛋白质的功能，而级数标记法主要用于数学函数的展开和逼近。

什么是序列比对,序列比对的用途有哪些

把你的序列输入框里，然后就点BLAST,就好啦

序列比对的定义

回答如下：序列对比是指比较两个或多个生物分子序列（如DNA、RNA或蛋白质序列）之间的相似性和差异性。序列对比可以帮助我们了解生物分子的进化和功能，并且可以用于诊断和治疗疾病。

以下是进行序列对比的一般步骤：

1. 收集序列数据：需要收集比较的序列数据，如DNA、RNA或蛋白质序列。这些序列可以从公共数据库中获取，如NCBI、EMBL或UniProt。

2. 对齐序列：对齐是将两个或多个序列进行比较，以确定它们之间的相似性和差异性。有许多对齐软件可用，如ClustalW、MAFFT或MUSCLE。

3. 分析序列：一旦序列对齐，可以对序列进行分析，如计算相似性、构建进化树或预测蛋白质结构等。

4. 评估结果：最后，需要评估序列比较的结果，并确定是否需要进一步的实验验证或数据分析。

需要注意的是，序列对比的结果可能会受到多种因素的影响，如序列长度、序列质量、对齐算法和分析方法等。因此，需要仔细评估序列对比的结果，并使用多种技术和方法来验证结果的准确性。

序列比对的主要用途有哪些

比较序列是生物信息学中最基本、最重要的操作,通过序列比对我们可以发现生物序列中的功能、结构 和进化的基本信息。比较序列的根本任务是:通过比较生物分子序列,发现它们的相似性,找出序列之间共 同的区域,同时辨别序列之间的差异。

什么是序列比对?及其基本分类?

1.协物比对 (Proportional Matching): 协物比对是寻找序列中具有最接近单一价值的残基之间的关系的一种方法。它被用来分析多个演变相关序列,其中每个序列有一个或者多个基因突变或碱基突变。它可以被用来以精确的方式确定序列中的改变,避免次等的变化的影响,并且可以提供结构信息。

2.层次分类法 (Hierarchical Clustering): 层次分类法是一种多序列比对分析方法,它将给定的序列分类到相当于分组的隔开组,它们拥有相同的最佳价值。在层次分类法中,给定的序列被组合成更大的节点,并且它们可以根据相似性,突变,残缺和布局来分类。层次分类法有助于创建一种共性的框架,可以提供关于编码信息的更进一步的联系,有助于研究了解复杂的数据集。